EpiNext? Post-Bisulfite DNA 文庫制備試劑盒是一整套優化的試劑,用于在亞硫酸氫鹽成功轉化后制備 DNA 文庫,用于各種基于 Illumina 平臺的亞硫酸氫鹽測序 (bisulfite-seq) 分析,例如全基因組亞硫酸氫鹽測序 (WGBS)、氧化亞硫酸氫鹽測序 (oxBs-seq)、還原代表性亞硫酸氫鹽測序 (RRBS) 和其他基于亞硫酸氫鹽的下一代測序應用。該試劑盒的優化方案和組分允許使用亞納克起始濃度的 DNA 快速構建非條形碼(單重)和條形碼(多重)DNA 文庫,因為 DNA 首先被亞硫酸氫鹽轉化,然后用于文庫制備。該套件具有以下優點和特點:
背景信息 目前有幾種方法,包括全基因組亞硫酸氫鹽測序 (WGBS) 和亞硫酸氫鹽低表達測序 (RRBS),用于全基因組 DNA 甲烷化分析。這些方法將未甲基化的胞嘧啶轉化為尿嘧啶,而 5-甲基胞嘧啶在亞硫酸氫鹽處理下保持不變。這使得表觀遺傳差異成為遺傳差異,隨后可以通過基于單一分辨率水平和全基因組尺度的測序來檢測。然而,目前這種方法的實際應用并不理想,因為它們 (1) 需要大量的 DNA (>1 μg) 作為輸入材料,這很難從有限的生物樣品(如腫瘤活檢、早期 embyros、embyronic 組織和循環 DNA)中制備;(2) 需要先剪切 DNA,然后連接到接頭上,然后進行亞硫酸氫鹽轉化(連接后亞硫酸氫鹽轉化),這會導致接頭 DNA 片段構建體中的大量 DNA 片段斷裂,從而形成單標簽模板,這些模板在文庫富集過程中被去除;(3) 耗時 (2 天)。EpiNext Post-Bisulfite DNA 文庫制備試劑盒旨在克服這些弱點。
原理和程序 使用此試劑盒,亞硫酸氫鹽處理的DNA(為單鏈形式)被轉化為雙鏈DNA,并直接用于與擴增和測序所必需的BisDNA特異性適配器進行連接。然后對片段進行大小選擇,并使用 MQ 微珠進行純化,從而可以快速、**地選擇 DNA 大小。然后用高保真 PCR 混合物擴增大小選擇的 DNA 片段,確保以*少的起始材料獲得*大產量,并以低錯誤率和*小偏差提供高度準確的文庫 DNA 擴增。
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